早在2018年9月，针对企业“注销难”的问题，税务总局就制发了《关于进一步优化办理企业税务注销程序的通知》，推出了清税证明免办、即办服务，并创新推出了“承诺制”容缺办理，大大简化了注销资料和流程。
注销营业执照的第1步就是要处理好税务问题。营业执照税务异常比较常见的一个原因就是没有按时进行记账和报税。还有就是长期零申报和经营地址异常：
税务异常的，在纳税人补充申报、补缴税款、滞纳金和罚款之后，就可以走正常的营业执照注销流程了。
注销营业执照的时间长又很麻烦，光国税局注销一般平均下来要10来趟，地税局10来趟，工商局也要4-5趟，银行3-4趟，这还是熟悉流程的人办理的时间，如果不懂流程的人去办理，估计来回跑的次数会更多，时间也更多。
罗列一下需要处理的税务种类：
注销营业执照肯定要先把国、地税注销掉（所得税在国税的，先注销地税；所得税在地税的，先注销国税）。
在进行税务注销的时候，要清算营业执照的增值税、企业所得税、增值税附加税、印花税等。如果从来没有报过税，那就是每个税种2000以内的罚款（具体多少和逾期时间有关）。而地税方面，还会特别收取租赁合同印花税，账本印花税、实收资本印花税等等。
由于税务注销的时候，需要提供营业执照近三年的帐本、会计凭证、财务报表等。如果营业执照从来没有记过账，那么就要重头开始补账。再加上注销之前难免要解决补账、补税、处理各类工商、税务变更等事项，不是一般的麻烦。
除了补账之外，税局还会要求出具清算报告，至少要出具*后一年的，有的税局要求每年都要有。而清算报告根据营业执照账务、税务的复杂情况来收费。
税务处理好了再进行营业执照注销
注销一般需要提交：营业执照清算组负责人或营业执照法定代表人签署的营业执照注销登记申请书；法院破产裁定、行政机关责令关闭的文件或营业执照依照《营业执照法》作出的决议；股东会或者有关机关确认的清算报告；刊登注销公告的报纸报样，以及法律、行政法规规定应当提交的其他文件。
如果是国有独资营业执照还应当提交国有资产监督管理机构的决定，其中，国务院确定的重要的国有独资营业执照，还应当提交本级人民政府的批准文件。
所以，一般情况下，上海营业执照注销这个事情还是交给代理机构好一些。